Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sp100O35892 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms