Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited2O35740 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cited2O35740 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cited2O35740 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cited2O35740 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cited2O35740 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cited2O35740 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cited2O35740 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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