Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp2O35711 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppfibp2O35711 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms