Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npc1O35604 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npc1O35604 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms