Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6aO35464 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6aO35464 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms