Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TnxbO35452 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TnxbO35452 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TnxbO35452 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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