Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppef2O35385 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms