Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gfra3O35118 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gfra3O35118 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gfra3O35118 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gfra3O35118 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gfra3O35118 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gfra3O35118 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gfra3O35118 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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