Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Cldn4O35054 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cldn4O35054 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Cldn4O35054 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Cldn4O35054 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Cldn4O35054 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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