Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Degs1O09005 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Degs1O09005 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Degs1O09005 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Degs1O09005 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Degs1O09005 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Degs1O09005 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms