Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ncoa3O09000 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncoa3O09000 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncoa3O09000 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms