Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PbsnO08976 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PbsnO08976 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PbsnO08976 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PbsnO08976 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms