Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NumblO08919 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NumblO08919 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NumblO08919 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NumblO08919 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NumblO08919 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NumblO08919 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NumblO08919 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NumblO08919 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NumblO08919 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NumblO08919 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NumblO08919 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms