Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms