Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dctn1O08788 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms