Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckarO08786 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckarO08786 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckarO08786 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckarO08786 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckarO08786 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckarO08786 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckarO08786 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms