Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sec22bO08547 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms