Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna5O08543 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna5O08543 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efna5O08543 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna5O08543 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna5O08543 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna5O08543 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms