Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccer2J3QPU5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms