Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5849J3QPE5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms