Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3727J3QM54 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3727J3QM54 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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