Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21244J3QK38 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms