Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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