Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20828J3KMI7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Gm20828J3KMI7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20828J3KMI7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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