Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm29394H3BIW7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29394H3BIW7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms