Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm8005F6YKY3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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