Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8220F6YKI2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms