Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6482F6YHC1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6482F6YHC1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms