Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17093F6XGJ4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17093F6XGJ4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms