Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28305F6U473 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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