Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngap1F6SEU4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngap1F6SEU4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms