Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm340F6RGI3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms