Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc7bE9Q9Y3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms