Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms