Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd35E9Q9D8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd35E9Q9D8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms