Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700024B05RikE9Q6D7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700024B05RikE9Q6D7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms