Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BC005561E9Q5E2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms