Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17175E9Q528 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17175E9Q528 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms