Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms