Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms