Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
6430550D23RikE9Q1X6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms