Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt78E9Q0F0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt78E9Q0F0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms