Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx60E9PZQ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx60E9PZQ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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