Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms