Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms