Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcn1E9PVA8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms