Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifit3bE9PV48 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms