Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb3D3Z6J4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms