Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms