Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms